Khác biệt trong phương pháp đào tạo của Đại học FPT là gắn kết chặt chẽ với các doanh nghiệp, đào tạo theo chương trình chuẩn công nghệ quốc tế, thành thạo hai ngoại ngữ, rèn luyện kỹ năng mềm, chú trọng phát triển con người toàn diện, hài hòa.


Mục tiêu của Trường Đại học FPT là đào tạo và cung cấp nguồn nhân lực chất lượng cao thuộc ngành Công nghệ thông tin (Chuyên ngành Kỹ thuật phần mềm, An toàn & Bảo mật thông tin, Thiết kế đồ họa, Trí tuệ nhân tạo, Internet vạn vật (IoT), Lập trình ô tô), Quản trị kinh doanh (Chuyên ngành Kinh doanh quốc tế, Quản trị kinh doanh, Quản trị dịch vụ du lịch và lữ hành, Quản trị Khách sạn, Quản trị truyền thông đa phương tiện, Thương mại điện tử), Ngôn ngữ Anh, Ngôn ngữ Hàn, Ngôn ngữ Nhật cho các doanh nghiệp trong nước, các tập đoàn nước ngoài và doanh nghiệp khởi sự từ sinh viên Đại học FPT.